Использование таких сканеров в аэропортах вызывает множество этических вопросов и возмущение организаций по защите частной жизни, поскольку позволяет увидеть детали контура тела человека, включая гениталии. Однако ранее управление транспортной безопасности США (TSA) заявляло, что сканеры не позволяют сохранять, распечатывать или передавать полученные изображения, убеждая пассажиров пользоваться этим более быстрым методом досмотра.

Как отмечает EPIС, сохранять и пересылать полученные сканы можно только в тестовом режиме оборудования. Однако из документов не совсем ясно, кто и когда может включить такой режим. Говорится, что доступ к тестовому режиму имеют обладатели "уровня безопасности Z", в число которых входят представители штаб-квартиры TSA, обслуживающие оборудование техник и "суперпользователи". При этом число пользователей полноразмерных сканеров с разными уровнями доступа может достигать 10 тыс. человек. EPIC опасается, что при возможности сохранять информацию на жестком диске сканера и передавать ее по интернету трехмерные изображения голых пассажиров окажутся в руках хакеров.

Британские правозащитники в свою очередь заявляют, что обязательный досмотр авиапассажиров с помощью сканеров, на которых видно все тело человека, нарушает закон о детской порнографии. По их словам, изображение, которое дает подобный сканер, настолько графично, что является по сути "виртуальным раздеванием".

Так, активисты правозащитной организации Action for Rights of Children призвали британское правительство предусмотреть исключения для детей и подростков младше 18 лет либо вообще отсрочить реализацию нововведения на практике из-за боязни, что персонал аэропорта может использовать полученные изображения в качестве порнографических снимков. Кроме нарушения прав детей правозащитники опасаются за образ различных знаменитостей, которым также придется пройти через сканирование.

В министерстве транспорта Британии подтвердили, что такая проблема существует и в настоящее время активно обсуждается.